É a decomposição de substâncias orgânicas por microorganismos. Pode ser aeróbia ou anaeróbia. Em ambos os casos ocorrem reacções de oxidação-redução,quer dizer,há transferência de electrões.
Na aeróbia,é o oxigénio o captador de electrões,sendo os produtos finais,no geral, anidrido carbónico e água. Na anaeróbia,a captação de electrões é feita por nitratos,sulfatos,ferro,
manganês e anidrido carbónico,sendo os produtos finais,no geral,metano e anidrido carbónico.
Os dois casos também podem ser designados por respiração,aeróbia e anaeróbia.
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